RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 SNAPC2Q13487 334 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 NBPF11Q86T75 865 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 FBXO3Q9UK99 471 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.01□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 KIF22Q14807 665 aa15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 FAM151AQ8WW52 585 aa15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ARMC5Q96C12 935 aa15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF341Q9BYN7 854 aa15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 LAMB1P07942 1786 aa15□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 POTEFA5A3E0 1075 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 CIAO1O76071 339 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 PPIL2Q13356 520 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ATP2B3Q16720 1220 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 SIL1Q9H173 461 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.99□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 IRF6O14896 467 aa14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 TLR2O60603 784 aa14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 PPATQ06203 517 aa14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 GCC1Q96CN9 775 aa14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 OTOFQ9HC10 1997 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 SEMA3EO15041 775 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 TCP10Q12799 353 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 USP40Q9NVE5 1235 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 BTBD19C9JJ37 291 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 PITPNM1O00562 1244 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 GNRH1P01148 92 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT4-211ENST00000498534 CENPFP49454 3210 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 INPP5BP32019 993 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 CAP1Q01518 475 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 HTTP42858 3142 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 AK9Q5TCS8 1911 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PRDX5P30044 214 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PRMT2P55345 433 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 SLF2Q8IX21 1173 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF333Q96JL9 665 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.93□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PHKA1P46020 1223 aa14.93□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 NFIAQ12857 509 aa14.93□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.93□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 COPRSQ9NQ92 184 aa14.93□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PDHXO00330 501 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 HOXD10P28358 340 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC102BQ68D86 513 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 C17orf99Q6UX52 265 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ABCF2Q9UG63 623 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 CXCL11O14625 94 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ENTPD3O75355 529 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 GNAI3P08754 354 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 TIMM10P62072 90 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PICK1Q9NRD5 415 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 CPA4Q9UI42 421 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 ADORA1P30542 326 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT4-211ENST00000498534 PSMC4P43686 418 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms