RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 INPP5BP32019 993 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 SLC5A1P13866 664 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 TCP10Q12799 353 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 PPIL2Q13356 520 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 KIF22Q14807 665 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 DCAF15Q66K64 600 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 HOOK2Q96ED9 719 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 LPIN2Q92539 896 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 KIF16BQ96L93 1317 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 PPATQ06203 517 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 FAM151AQ8WW52 585 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 SIL1Q9H173 461 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 CPA4Q9UI42 421 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 NFIAQ12857 509 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 CTGFP29279 349 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 PRDX5P30044 214 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 E9PSI1 815 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 C17orf99Q6UX52 265 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 USP40Q9NVE5 1235 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 PDHXO00330 501 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 SLFN5Q08AF3 891 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 ATP2B3Q16720 1220 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 PSMC4P43686 418 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 MOGSQ13724 837 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 GNRH1P01148 92 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 PHKA1P46020 1223 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 MTFR1Q15390 333 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM47Q96LD4 638 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRN-217ENST00000489650 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 PRMT2P55345 433 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 SRRDQ9UH36 339 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 OSBPP22059 807 aa23■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 ADORA1P30542 326 aa23■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 MYH2Q9UKX2 1941 aa23■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 CIAO1O76071 339 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 SLURP2P0DP57 97 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 CYP2C8P10632 490 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 RGS3P49796 1198 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 RAET1EQ8TD07 263 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 FBXO3Q9UK99 471 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 H0YGN5 161 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 HOXD10P28358 340 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 SHISA4Q96DD7 197 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 MYPNQ86TC9 1320 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 GRK4P32298 578 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 TIMM10P62072 90 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC102BQ68D86 513 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 DOCK2Q92608 1830 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN-217ENST00000489650 CXCL11O14625 94 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 SEMA3EO15041 775 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 MGAMO43451 1857 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 ABCF2Q9UG63 623 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 ENTPD3O75355 529 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 BCRP11274 1271 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 DPF3Q92784 378 aa22.94■■□□□ 1.26
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