RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488541.1

PRKCI-206, Transcript of protein kinase C iota, human

TSL 2

Gene PRKCI, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCI-206	ENST00000488541	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRKCI-206	ENST00000488541	ADCY9	O60503	1353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	MEN1	O00255	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	GNB5	O14775	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	A1BG	P04217	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	NEFL	P07196	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	AMPD1	P23109	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	MAP2K3	P46734	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	SCTR	P47872	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	SIK1	P57059	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ITPK1	Q13572	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	AAMP	Q13685	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541		A0A1W2PRU2	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541		F6X3S4	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	STARD3NL	O95772	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ANXA1	P04083	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	GPC1	P35052	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	POU4F2	Q12837	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	COPS6	Q7L5N1	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	UTY	O14607	1347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	PLSCR1	O15162	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	TRIM37	O94972	964 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	MYL6B	P14649	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCI-206	ENST00000488541	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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