RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 SNAP23O00161 211 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SGSM2O43147 1006 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 REC8O95072 547 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PTH1RQ03431 593 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 MTMR2Q13614 643 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SCARF1Q14162 830 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 BECN1Q14457 450 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 METTL24Q5JXM2 366 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 XAGE2Q96GT9 111 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 FSD1Q9BTV5 496 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 GPR108Q9NPR9 543 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 EP400Q96L91 3159 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CFAP99D6REC4 459 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 GOLIM4O00461 696 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TAF5LO75529 589 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 GJA5P36382 358 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ATP2B3Q16720 1220 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TXNRD1Q16881 649 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 POTEAQ6S8J7 498 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PI16Q6UXB8 463 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SLC51AQ86UW1 340 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PRR7Q8TB68 274 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 HAUS7Q99871 368 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.4□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 JUNDP17535 347 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RXRBP28702 533 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RFC4P35249 363 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MCM6Q14566 821 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NFIXQ14938 502 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 GORABQ5T7V8 394 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SETDB2Q96T68 719 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MYH7P12883 1935 aa7.39□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 APBA3O96018 575 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SLC19A1P41440 591 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ZAP70P43403 619 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PHKA1P46020 1223 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RABEP1Q15276 862 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF827Q17R98 1081 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 HSCBQ8IWL3 235 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SNX21Q969T3 373 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RTL9Q8NET4 1388 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RAD50Q92878 1312 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 LILRB3O75022 631 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PDE8BO95263 885 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 GYS1P13807 737 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CPA1P15085 419 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 FGFR2P21802 821 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 HSPA4P34932 840 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CHRNDQ07001 517 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SPRYD7Q5W111 196 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms