RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TLR2	O60603	784 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC24	Q50LG9	513 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	DLL1	O00548	723 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	RLBP1	P12271	317 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SNAPC2	Q13487	334 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	VGLL4	Q14135	290 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	METTL24	Q5JXM2	366 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	RAET1E	Q8TD07	263 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SSH3	Q8TE77	659 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	LPIN2	Q92539	896 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SRGAP3	O43295	1099 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	UBXN2A	P68543	259 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	POLA2	Q14181	598 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ERO1B	Q86YB8	467 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM47	Q96LD4	638 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CAPN2	P17655	700 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP8B2	P98198	1209 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	DCAF15	Q66K64	600 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	VPS37D	Q86XT2	251 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PPC1	479 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PLIN1	O60240	522 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	GRK4	P32298	578 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CRK	P46108	304 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	WRNIP1	Q96S55	665 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	MRI	Q9BWK5	157 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	MAST3	O60307	1309 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	BTBD19	C9JJ37	291 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	SEMA3E	O15041	775 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC5A1	P13866	664 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMC4	P43686	418 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	GJA8	P48165	433 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PPIL2	Q13356	520 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF208	Q9H0X6	261 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR108	Q9NPR9	543 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	SRRD	Q9UH36	339 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	MYPN	Q86TC9	1320 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	GJB1	P08034	283 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	GYG1	P46976	350 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CAP1	Q01518	475 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP2B3	Q16720	1220 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	TEKT1	Q969V4	418 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	TEPSIN	Q96N21	525 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0C4DFX4	3053 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	AOX1	Q06278	1338 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	SZT2	Q5T011	3432 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	MGAM	O43451	1857 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	CCL5	P13501	91 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TTLL3-223	ENST00000466245	FCGRT	P55899	365 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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