RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429794.1

CITED1-205, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-205ENST00000429794 PPIL2Q13356 520 aa15.48■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 SNAPC2Q13487 334 aa15.48■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.48■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 POTEFA5A3E0 1075 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 IRF6O14896 467 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 SEMA3EO15041 775 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 TLR2O60603 784 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CAP1Q01518 475 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 FAM151AQ8WW52 585 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 GCC1Q96CN9 775 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.47■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 GNRH1P01148 92 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 PPATQ06203 517 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ATP2B3Q16720 1220 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 NBPF11Q86T75 865 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ZNF333Q96JL9 665 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.46■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 DOCK2Q92608 1830 aa15.45■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 BTBD19C9JJ37 291 aa15.45■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.45■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.45■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 PRDX5P30044 214 aa15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 KIF22Q14807 665 aa15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.44■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 PRMT2P55345 433 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 SIL1Q9H173 461 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 COPRSQ9NQ92 184 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 INPP5BP32019 993 aa15.42■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 NFIAQ12857 509 aa15.42■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.42■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 PHKA1P46020 1223 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 TCP10Q12799 353 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 C17orf99Q6UX52 265 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 IDI2Q9BXS1 227 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 USP40Q9NVE5 1235 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 GAKO14976 1311 aa15.41■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.4■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 CCDC102BQ68D86 513 aa15.4■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.4■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 PTPRFP10586 1907 aa15.4■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.4■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 MGAMO43451 1857 aa15.4■□□□□ 0.06
CITED1-205ENST00000429794 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 PDHXO00330 501 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 CXCL11O14625 94 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 ENTPD3O75355 529 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 SLF2Q8IX21 1173 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 DOCK1Q14185 1865 aa15.39■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 GNAI3P08754 354 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 HOXD10P28358 340 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 MTX1Q13505 466 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 MOGSQ13724 837 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 RASGRF1Q13972 1273 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 MEIS3Q99687 375 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.38■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 ADORA1P30542 326 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 RGS3P49796 1198 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 MAP3K10Q02779 954 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 SRRDQ9UH36 339 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 CPA4Q9UI42 421 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 A0A1B0GUL7 405 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-205ENST00000429794 PSMC4P43686 418 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms