RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423413.1

TNS1-206, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-206ENST00000423413 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.59□□□□□ -0.23
TNS1-206ENST00000423413 DBNDD2Q9BQY9 259 aa13.59□□□□□ -0.23
TNS1-206ENST00000423413 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
TNS1-206ENST00000423413 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.58□□□□□ -0.23
TNS1-206ENST00000423413 RAB11FIP3O75154 756 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 LDHCP07864 332 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MCAMP43121 646 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 PRDM10Q9NQV6 1147 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 LRP2BPQ9P2M1 347 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 GAKO14976 1311 aa13.58□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CACNB3P54284 484 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 AACSQ86V21 672 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 TEPSINQ96N21 525 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 USP40Q9NVE5 1235 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 RAI14Q9P0K7 980 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa13.57□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MECOMQ03112 1051 aa13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 DCAF15Q66K64 600 aa13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 FAM151AQ8WW52 585 aa13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 FOCADQ5VW36 1801 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 LBX1P52954 281 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 SREBF2Q12772 1141 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 PI16Q6UXB8 463 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 ZIC5Q96T25 663 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 ENTPD3O75355 529 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 BTDP43251 543 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 TCP10Q12799 353 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 SPRYD7Q5W111 196 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CSRNP1Q96S65 589 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 IDI2Q9BXS1 227 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 SNRKQ9NRH2 765 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 FZD1Q9UP38 647 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CSADQ9Y600 493 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MYH7P12883 1935 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 APBB1O00213 710 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 BAG3O95817 575 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 INHBEP58166 350 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MAP3K9P80192 1104 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 WNK4Q96J92 1243 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-206ENST00000423413 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 PLCG2P16885 1265 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 ZAP70P43403 619 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 TM4SF4P48230 202 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 RGS3P49796 1198 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 NFIAQ12857 509 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 ZNF341Q9BYN7 854 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 RNF186Q9NXI6 227 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 MAP3K12Q12852 859 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 CERS3Q8IU89 383 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 TNS4Q8IZW8 715 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 WRNIP1Q96S55 665 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 FAM198AQ9UFP1 575 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 RFX7Q2KHR2 1363 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 TRPA1O75762 1119 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 IDH1O75874 414 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 ALDH1A1P00352 501 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 RHBDL3P58872 404 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-206ENST00000423413 VGLL4Q14135 290 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms