RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421046.5

UPP1-206, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 974 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-206ENST00000421046 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 SPATA5Q8NB90 893 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 MCAMP43121 646 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 SLF2Q8IX21 1173 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 PI16Q6UXB8 463 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-206ENST00000421046 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 GAKO14976 1311 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 HMMRO75330 724 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 USP40Q9NVE5 1235 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 RNF186Q9NXI6 227 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 DOCK2Q92608 1830 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 TRPA1O75762 1119 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 SPRYD7Q5W111 196 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 HOOK2Q96ED9 719 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 MECOMQ03112 1051 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 FAM151AQ8WW52 585 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 WNK4Q96J92 1243 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 TM4SF4P48230 202 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 SNRKQ9NRH2 765 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 RAI14Q9P0K7 980 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 GSTO1P78417 241 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 SREBF2Q12772 1141 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 TCP10Q12799 353 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 NFIAQ12857 509 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 LDHCP07864 332 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 BTDP43251 543 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-206ENST00000421046 MAP3K9P80192 1104 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 DCAF15Q66K64 600 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 AACSQ86V21 672 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ZNF384Q8TF68 577 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ELP3Q9H9T3 547 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 CSADQ9Y600 493 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 IDI2Q9BXS1 227 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 APBB1O00213 710 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ZAP70P43403 619 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 RGS3P49796 1198 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 INHBEP58166 350 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 VGLL4Q14135 290 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 WRNIP1Q96S55 665 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 FOCADQ5VW36 1801 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 RAB11FIP3O75154 756 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ENTPD3O75355 529 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 GJA5P36382 358 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 OPTNQ96CV9 577 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 RHBDL3P58872 404 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 IGSF3O75054 1194 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 TBC1D8O95759 1140 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 PICALMQ13492 652 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UPP1-206ENST00000421046 ALDH1A1P00352 501 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms