RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.48□□□□□ -0.73
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLRN2A0PK11 232 aa10.47□□□□□ -0.73
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC10A3P09131 477 aa10.47□□□□□ -0.73
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAF15Q66K64 600 aa10.47□□□□□ -0.73
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPATCH3Q96I76 525 aa10.46□□□□□ -0.73
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AK9Q5TCS8 1911 aa10.45□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.45□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEPSINQ96N21 525 aa10.45□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WBP1LQ9NX94 342 aa10.45□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAI14Q9P0K7 980 aa10.45□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOCADQ5VW36 1801 aa10.44□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.44□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTDP43251 543 aa10.44□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.44□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYH7P12883 1935 aa10.44□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP5JP18859 108 aa10.43□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INHBEP58166 350 aa10.43□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP4CP60510 307 aa10.43□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.43□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP40Q9NVE5 1235 aa10.43□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AOX1Q06278 1338 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZAP70P43403 619 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRBNQ96SW2 442 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSADQ9Y600 493 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.42□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APBB1O00213 710 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERC2O15083 957 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH1A1P00352 501 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RHBDL3P58872 404 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRM1Q13255 1194 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLK2Q6UY11 383 aa10.41□□□□□ -0.74
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