RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 CBLN1P23435 193 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 GPR183P32249 361 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CCR6P51684 374 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PAX9P55771 341 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 ERVK-16P61578 105 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PPP1R1AQ13522 171 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 RPEL1Q2QD12 228 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PYDC2Q56P42 97 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SLC35G3Q8N808 338 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 LRTM2Q8N967 370 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR52E5Q8NH55 327 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR10C1Q96KK4 312 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CXorf58Q96LI9 332 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TSC22D3Q99576 134 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 HINT2Q9BX68 163 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 COPZ2Q9P299 210 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 DNAH2Q9P225 4427 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 A0A087X002 238 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 A0A0B4J2A0 478 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 A0A1B0GU03 582 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CCDC160A6NGH7 325 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR2T8A6NH00 312 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SNURFLB1AK76 121 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PRSS46E5RG02 174 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PRAF2O60831 178 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 NDUFB6O95139 128 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 DHFRP00374 187 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 MT-CO2P00403 227 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 DEFA4P12838 97 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 S100GP29377 79 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SPCS3P61009 180 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 IFITM3Q01628 133 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TRIM16LQ309B1 348 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR4A16Q8NH70 328 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR4C12Q96R67 309 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 MCUBQ9NWR8 336 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 KMT2AQ03164 3969 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 C5orf52A6NGY3 159 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 MPTX1A8MV57 137 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 K7EMT4 169 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 NDUFA4O00483 81 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SFT2D2O95562 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM50AO95807 157 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 CD7P09564 240 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 AKR1C4P17516 323 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 S100A5P33763 92 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 AKR1C2P52895 323 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TNFRSF9Q07011 255 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 C2orf83Q53S99 150 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TXN2Q99757 166 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF8-211ENST00000574728 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.8 ms