RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RNF141Q8WVD5 230 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 GPR82Q96P67 336 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RSG1Q9BU20 258 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 A0A087WW49 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ZNF320A2RRD8 509 aa7.15□□□□□ -1.26
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CS-220ENST00000550700 OR5G3P0C626 314 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ORM2P19652 201 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 MEOX2P50222 304 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 LYZP61626 148 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 BLOC1S1P78537 153 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 MIC13Q5XKP0 118 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 TEX261Q6UWH6 196 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 RAX2Q96IS3 184 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRX2 142 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TRBV12-3P01733 135 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CRYBB3P26998 211 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SULT1A2P50226 295 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TMED6Q8WW62 240 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 FUT9Q9Y231 359 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ZFHX3Q15911 3703 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 COL6A5A8TX70 2615 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 HELTA6NFD8 242 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 OVOL1O14753 267 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 HBE1P02100 147 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 INSL3P51460 131 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SYNJ2BPP57105 145 aa7.13□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 KHDC3LQ587J8 217 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 FAM78BQ5VT40 261 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 U3KQE9 123 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 C8orf88P0DMB2 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 GALR1P47211 349 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PPT1P50897 306 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 DEFB136Q30KP8 78 aa7.12□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RPRMQ9NS64 109 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SMPXQ9UHP9 88 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.11□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 BUB3O43684 328 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CXorf1O96002 111 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.11□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 SLURP1P55000 103 aa7.11□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.11□□□□□ -1.27
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