RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAX2Q96IS3 184 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 METTL26Q96S19 204 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF2Q99496 336 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FHITP49789 147 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BLOC1S1P78537 153 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TM4SF20Q53R12 229 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCN15Q6UWW0 184 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1QL4Q86Z23 238 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB24Q969Q5 203 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UHRF2Q96PU4 802 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A22Q9H936 323 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FUT9Q9Y231 359 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTORP42345 2549 aa6.52□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GV50 99 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 K7EMT4 169 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C8orf88P0DMB2 117 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYCNOSP40205 109 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LEMD1Q68G75 181 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CITED1Q99966 193 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF747Q9BV97 191 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF98A6NK75 572 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX46H3BTG2 121 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGALS9O00182 355 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGS13O14921 159 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PF4P02776 101 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYBB3P26998 211 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAS2R45P59539 299 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF726P1Q15940 193 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 REC114Q7Z4M0 266 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4F4Q96R69 305 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HRH4Q9H3N8 390 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PEMTQ9UBM1 199 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF24Q9Y225 148 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PS18 150 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H3BRN7 92 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0QZ24 198 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OVOL1O14753 267 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR7C2O60412 319 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXorf1O96002 111 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HBE1P02100 147 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BMI1P35226 326 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FHL3Q13643 280 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KHDC3LQ587J8 217 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MORN5Q5VZ52 161 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSX7Q7RTT5 188 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAXXQ9BUH6 204 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51M1Q9H341 326 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMPXQ9UHP9 88 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAST4O15021 2626 aa6.49□□□□□ -1.37
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