RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		1.02	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	PATE1	Q8WXA2	126 aa		1.02	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		1.02	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		1.02	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	FBN2	P35556	2912 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802		A8MWV9	139 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CCL25	O15444	150 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CCL16	O15467	120 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CAPZB	P47756	277 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	BORCS5	Q969J3	196 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	PHB2	Q99623	299 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	EML5	Q05BV3	1969 aa		1	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CST8	O60676	142 aa		1	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TMED2	Q15363	201 aa		1	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		1	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802		M0R378	163 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP5H	O75947	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	C1QB	P02746	253 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	UBE2B	P63146	152 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	AMELY	Q99218	206 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	NOTCH1	P46531	2555 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	DNAL4	O96015	105 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	SPRN	Q5BIV9	151 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	ARL5A	Q9Y689	179 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	LAMA4	Q16363	1823 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	ROMO1	P60602	79 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	NCALD	P61601	193 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	MYL5	Q02045	173 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TP53RK	Q96S44	253 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXA6	P31267	233 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	C2orf82	Q6UX34	121 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	CEP19	Q96LK0	163 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	TEX37	Q96LM6	180 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	MIA2	Q96PC5	1412 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802		B4DSR2	109 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	NUPR1	O60356	82 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFC2	O95298	119 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	HLA-E	P13747	358 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PSG9	Q00887	426 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	C4orf22	Q6V702	233 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PXT1	Q8NFP0	134 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PCTP	Q9UKL6	214 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802		E7EUB6	86 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	NCR3	O14931	201 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	BANF1	O75531	89 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	CD2	P06729	351 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	DYNLT3	P51808	116 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	ARF6	P62330	175 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802		Q8N6K4	173 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00052	Q96N35	136 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	MED29	Q9NX70	200 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PEAK1	Q9H792	1746 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	ARHGEF11	O15085	1522 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802		E9PCH4	1651 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	TLCD2	A6NGC4	264 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	NFYB	P25208	207 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	HACD4	Q5VWC8	232 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	PRND	Q9UKY0	176 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKAP2-208	ENST00000495802	AIP	O00170	330 aa		0.92	□□□□□ -2.26

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