RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-215ENST00000494945 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 FAM210AQ96ND0 272 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 RNF24Q9Y225 148 aa8.51□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 NDUFA4O00483 81 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 UHRF2Q96PU4 802 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 MANBALQ9NQG1 85 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 RABAC1Q9UI14 185 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 H3BRN7 92 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TRBV12-3P01733 135 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 GCHFRP30047 84 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 GUK1Q16774 197 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 MORN5Q5VZ52 161 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 GNG13Q9P2W3 67 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 RNF114Q9Y508 228 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 A0A1B0GUS0 222 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 OR7C2O60412 319 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ATP6V1G1O75348 118 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 CD5P06127 495 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 BCL2P10415 239 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 PROK1P58294 105 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 PEA15Q15121 130 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TOR2AQ5JU69 321 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 GPHB5Q86YW7 130 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SUN5Q8TC36 379 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 OR5B12Q96R08 314 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 CITED4Q96RK1 184 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 METTL26Q96S19 204 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 PAXXQ9BUH6 204 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 OR51M1Q9H341 326 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 MAST4O15021 2626 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ZNF98A6NK75 572 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 I3L521 148 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 HAGHQ16775 308 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 RPEL1Q2QD12 228 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 ZNF503Q96F45 646 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 VAX2Q9UIW0 290 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.46□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PKP4-215ENST00000494945 GP9P14770 177 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 ZP3P21754 424 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 NPPCP23582 126 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 CRYBB3P26998 211 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 ICAM4Q14773 271 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 FXYD5Q96DB9 178 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 TREM1Q9NP99 234 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 U3KQE9 123 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 A0A087WW49 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 K7EMT4 169 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 HAX1O00165 279 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 PAGE4O60829 102 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 PYYP10082 97 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 CD28P10747 220 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-215ENST00000494945 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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