RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 MGST2Q99735 147 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 COL6A5A8TX70 2615 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 A0A087WW49 117 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 LINC01619G3V211 115 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 I3L521 148 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 AGPAT2O15120 278 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 YIF1AO95070 293 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 TOMM40O96008 361 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ZP3P21754 424 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP10-3P60369 221 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF616Q08AN1 781 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 RPEL1Q2QD12 228 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 SLC51BQ86UW2 128 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 C3orf56Q8N813 242 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 STOML3Q8TAV4 291 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 DPF1Q92782 380 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CITED1Q99966 193 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 RSG1Q9BU20 258 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 STAB1Q9NY15 2570 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 COX7A2P2O60397 106 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CTSGP08311 255 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 LINC00869P0C866 280 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 RD3LP0DJH9 198 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ATP6V0CP27449 155 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 LYZP61626 148 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 B2MP61769 119 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF90Q03938 601 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 MIC13Q5XKP0 118 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 Q8WTZ3 238 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 GINS3Q9BRX5 216 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 CCL24O00175 119 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 NDUFA4O00483 81 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR2C1O95371 312 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 IL4P05112 153 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PSG1P11464 419 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 FHL3Q13643 280 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 BAP18Q8IXM2 172 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR11H1Q8NG94 326 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 RNF125Q96EQ8 232 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 DUX3Q96PT4 197 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR4F4Q96R69 305 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ARV1Q9H2C2 271 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 DOK5Q9P104 306 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF320A2RRD8 509 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 M0QZ24 198 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 OR5G3P0C626 314 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 ORM2P19652 201 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 S100A7P31151 101 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 MYCNOSP40205 109 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-218ENST00000487565 SYNJ2BPP57105 145 aa5.85□□□□□ -1.47
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