RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PATE2Q6UY27 113 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-210ENST00000477812 HYLS1Q96M11 299 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-210ENST00000477812 RSG1Q9BU20 258 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-210ENST00000477812 DOK5Q9P104 306 aa15.05■□□□□ -0
ACTB-210ENST00000477812 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-210ENST00000477812 A0A0D9SG52 128 aa15.04■□□□□ -0
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ACTB-210ENST00000477812 BUB3O43684 328 aa15.04■□□□□ -0
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ACTB-210ENST00000477812 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
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ACTB-210ENST00000477812 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-210ENST00000477812 HELTA6NFD8 242 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 S100A7P31151 101 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 STOML3Q8TAV4 291 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 C17orf77Q96MU5 243 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
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