RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 CCSO14618 274 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 DEDDO75618 318 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 CSTL1Q9H114 145 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 K7EPK0 472 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 ID1P41134 155 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 MEOX2P50222 304 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 DEFB131AP59861 70 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 RAB31Q13636 194 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 STHQ8IWL8 128 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 SPRY2O43597 315 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 BCAP31P51572 246 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 RAP2BP61225 183 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 HBG1P69891 147 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 HBG2P69892 147 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 IL15RAQ13261 267 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 NMES1Q9C002 83 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 RNF183Q96D59 192 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 ZNF98A6NK75 572 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 ZNF688P0C7X2 276 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 RAB32Q13637 225 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 ISLRO14498 428 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-211ENST00000476336 LINC00869P0C866 280 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-211ENST00000476336 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 E5RGE8 158 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SSNA1O43805 119 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 MPDU1O75352 247 aa9.82□□□□□ -0.84
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PRAME-211ENST00000476336 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 RETNQ9HD89 108 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 AGPAT2O15120 278 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 CCNKO75909 580 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 OR5G3P0C626 314 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 ZNF124Q15973 351 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 VWC2Q2TAL6 325 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 ARL6Q9H0F7 186 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A22Q9H936 323 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 RYR2Q92736 4967 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 H3BRN7 92 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 CST7O76096 145 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
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