RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 CD81P60033 236 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 Q6ZRG5 221 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF709Q8N972 641 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 U3KQE9 123 aa16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF785A8K8V0 405 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 K7EIL1 84 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 OR5G3P0C626 314 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 C1orf194Q5T5A4 169 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 Q6ZNX1 250 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ARL6Q9H0F7 186 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 BUB3O43684 328 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 PLP1P60201 277 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 SCGB1C1Q8TD33 95 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 AQP10Q96PS8 301 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 NEURL2Q9BR09 285 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 GGTLC1Q9BX51 225 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 DOK5Q9P104 306 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 COX7A2P2O60397 106 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM90A2PQ658T7 463 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAV2A0A0B4J234 112 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 RPL29P47914 159 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 TFPI2P48307 235 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 OPCMLQ14982 345 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 OR8I2Q8N0Y5 310 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 STPG3Q8N7X2 389 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 OR1L4Q8NGR5 311 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 GLMPQ8WWB7 406 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 NPCDR1Q9BY65 106 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SORL1Q92673 2214 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 B2MP61769 119 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF266Q14584 549 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 Q5BKY6 102 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 GBGT1Q8N5D6 347 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR82Q96P67 336 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PFDN5Q99471 154 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 MS4A6AQ9H2W1 248 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC25A22Q9H936 323 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 MIC13Q5XKP0 118 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 ARV1Q9H2C2 271 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC39A9Q9NUM3 307 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF98A6NK75 572 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 GALR1P47211 349 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PRR20EP86478 221 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PRR20CP86479 221 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PRR20DP86480 221 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PRR20BP86481 221 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PRR20AP86496 221 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 WFDC3Q8IUB2 231 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 TUBA4BQ9H853 241 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 H3BRN7 92 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 CD7P09564 240 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SAMD13Q5VXD3 122 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 NRN1Q9NPD7 142 aa16.29■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 OR11H12B2RN74 326 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 ARPC5O15511 151 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 LINC00305Q7Z4B0 112 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 Q8N1Y9 231 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa16.28■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 RPL7P18124 248 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 MEOX2P50222 304 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 UHRF2Q96PU4 802 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.27■□□□□ 0.2
RALGPS1-212ENST00000472427 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.26■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 SMLR1H3BR10 107 aa16.26■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.26■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 GATAD1Q8WUU5 269 aa16.26■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 MFFQ9GZY8 342 aa16.26■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.26■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF222A6NCQ9 220 aa16.25■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 G3V3Q6 166 aa16.25■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RALGPS1-212ENST00000472427 LEMD1Q68G75 181 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms