RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 HOXB5P09067 269 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 PLP1P60201 277 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SLC35E1Q96K37 410 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 DNAH2Q9P225 4427 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 WRBO00258 174 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 OR4E1P0C645 316 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 PSMB3P49720 205 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 TCTAP57738 103 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 RAB11AP62491 216 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 OR2F1Q13607 317 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C12orf74Q32Q52 190 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 AMTNQ6UX39 209 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM8Q96KF7 97 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C20orf173Q96LM9 149 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 FBXL17Q9UF56 701 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 CELA1Q9UNI1 258 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF98A6NK75 572 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 K7EPK0 472 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 ISLRO14498 428 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 HLA-DMBP28068 263 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 MITD1Q8WV92 249 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 XCL2Q9UBD3 114 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 HERC2O95714 4834 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0J9YX75 114 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 CCDC160A6NGH7 325 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C11orf94C9JXX5 98 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 FNDC10F2Z333 226 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 DEDDO75618 318 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 CCNKO75909 580 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 FABP1P07148 127 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 IL7P13232 177 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 LYZP61626 148 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 IL15RAQ13261 267 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZTC4 211 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-232ENST00000470482 TAS2R30P59541 319 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 ARL16Q0P5N6 197 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 C4orf46Q504U0 113 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 PATE2Q6UY27 113 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 F6UB75 175 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 H3BP45 60 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 H3BRN7 92 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 DLK1P80370 383 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 C7orf66A4D0T2 115 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 TSC22D2O75157 780 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 ID1P41134 155 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 MEOX2P50222 304 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 FAM78BQ5VT40 261 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 COQ8AQ8NI60 647 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00052Q96N35 136 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 RSG1Q9BU20 258 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 RNF126Q9BV68 326 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-232ENST00000470482 PSENENQ9NZ42 101 aa8.37□□□□□ -1.07
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