RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466635.1

SYP-203, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-203ENST00000466635 PLP1P60201 277 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 OPCMLQ14982 345 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 STPG3Q8N7X2 389 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 ST8SIA2Q92186 375 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 NEURL2Q9BR09 285 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 ARL6Q9H0F7 186 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 WFDC1Q9HC57 220 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 RNF24Q9Y225 148 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 U3KQE9 123 aa10.17□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 HELTA6NFD8 242 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 COX7A2P2O60397 106 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 B2MP61769 119 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PRR20EP86478 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PRR20CP86479 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PRR20DP86480 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PRR20BP86481 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PRR20AP86496 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 GUCA2BQ16661 112 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 MIC13Q5XKP0 118 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 RNF2Q99496 336 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 DOK5Q9P104 306 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.16□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 A0A0D9SG52 128 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 BUB3O43684 328 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 C1QBP02746 253 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 GP9P14770 177 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 PAFAH1B2P68402 229 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 ZNF345Q14585 488 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 C16orf54Q6UWD8 224 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 TCF24Q7RTU0 167 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 TMEM61Q8N0U2 210 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 ARV1Q9H2C2 271 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.15□□□□□ -0.78
SYP-203ENST00000466635 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.15□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 TSPAN4O14817 238 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 JTBO76095 146 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 KRTAP10-11P60412 298 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 KCNRGQ8N5I3 272 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 HYLS1Q96M11 299 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 PFDN5Q99471 154 aa10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 OR4C46A6NHA9 309 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 ZNF98A6NK75 572 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 FAM90A2PQ658T7 463 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GLMPQ8WWB7 406 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GPR82Q96P67 336 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 RSG1Q9BU20 258 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 SLC25A22Q9H936 323 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.13□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 ZNF785A8K8V0 405 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 H3BRN7 92 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 PFDN1O60925 122 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 ZFP69Q49AA0 526 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 FFAR4Q5NUL3 377 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 PATE2Q6UY27 113 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 UHRF2Q96PU4 802 aa10.12□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 CXCL2P19875 107 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GALR1P47211 349 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 PRR25Q96S07 402 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 MS4A6AQ9H2W1 248 aa10.11□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10.1□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 BCL2L11O43521 198 aa10.1□□□□□ -0.79
SYP-203ENST00000466635 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms