RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF125Q96EQ8 232 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35E1Q96K37 410 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL26Q96S19 204 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TRGV9Q99603 122 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TENM2Q9NT68 2774 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4C46A6NHA9 309 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP92A6NM28 416 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KNCNA6PVL3 124 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF688P0C7X2 276 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 LYZP61626 148 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CASC10Q5T4H9 136 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC7Q8TAX7 377 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 RABAC1Q9UI14 185 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PS18 150 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf51A6NDU8 294 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YIZ8 118 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SOCS3O14543 225 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB32Q13637 225 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB135Q30KP9 77 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 PATE2Q6UY27 113 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf173Q96LM9 149 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf50Q96LR7 162 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 BATF3Q9NR55 127 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KMT2AQ03164 3969 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 IGSF23A1L1A6 192 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF98A6NK75 572 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf84H3BNL1 204 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRY2O43597 315 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TSC22D2O75157 780 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 C4BPBP20851 252 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 MORN5Q5VZ52 161 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF183Q96D59 192 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB40CQ96S21 281 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CSTL1Q9H114 145 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 DOK5Q9P104 306 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YWU9 116 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SMCO3A2RU48 225 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BRN7 92 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 GOSR2O14653 212 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CST7O76096 145 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CD5P06127 495 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00869P0C866 280 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ORM2P19652 201 aa5.11□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 BMI1P35226 326 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1C1Q04828 323 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMG4Q5JS54 123 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZWC4 215 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ENKURQ8TC29 256 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 MGST2Q99735 147 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.11□□□□□ -1.59
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