RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPPCP23582 126 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLURP1P55000 103 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYNJ2BPP57105 145 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 REC114Q7Z4M0 266 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DUX3Q96PT4 197 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DOK5Q9P104 306 aa7.88□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1W2PPV4 95 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1W2PS18 150 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFNA7P01567 189 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPP1P10451 314 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M6PRP20645 277 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLP1P60201 277 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RHOBP62745 196 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FHL3Q13643 280 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N3U1 123 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMED6Q8WW62 240 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MARC2Q969Z3 335 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARV1Q9H2C2 271 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.87□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A8MWP6 167 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7EMT4 169 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OVOL1O14753 267 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB5CP51148 216 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAS2R45P59539 299 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM78BQ5VT40 261 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEX46H3BTG2 121 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD5P06127 495 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD33P20138 364 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB2AP61019 212 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TM4SF20Q53R12 229 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KHDC3LQ587J8 217 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF141Q8WVD5 230 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR82Q96P67 336 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A22Q9H936 323 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FUT9Q9Y231 359 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf70A6NJV1 201 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3BRN7 92 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRYBB3P26998 211 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GALR1P47211 349 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEX261Q6UWH6 196 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UHRF2Q96PU4 802 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MDFIQ99750 246 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM213A2RRL7 107 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HELTA6NFD8 242 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF98A6NK75 572 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR7C2O60412 319 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms