RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 DAD1P61803 113 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM250H0YL14 139 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 CACNG7P62955 275 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM50AO95807 157 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TAS2R60P59551 318 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGKV1-16P04430 117 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 COX6CP09669 75 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF98A6NK75 572 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 CNTFRP26992 372 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 CREBBPQ92793 2442 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 F5H768 121 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ELANEP08246 267 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00205P59089 165 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF843Q8N446 348 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 GFI1Q99684 422 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TDGF1P3P51864 188 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 XCL2Q9UBD3 114 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 PTPRDP23468 1912 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 A6NJY4 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 DIRC3C9JPN6 131 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 H3BVH4 76 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TOMM40O96008 361 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 MPDZO75970 2070 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 RNF144BQ7Z419 303 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GW15 77 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 EREGO14944 169 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGHV2-70P01814 119 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 EFNB1P98172 346 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00477Q96M19 166 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 FGF16O43320 207 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ITGB1BP1O14713 200 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF138P52744 262 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ID3Q02535 119 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TREML4Q6UXN2 200 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 C18orf15Q96N68 181 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 SLC17A3O00476 420 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 AMBPP02760 352 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 NTF4P34130 210 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1W2PRE2 83 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 C22orf46C9J442 243 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 VCX2Q9H322 139 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 NRN1Q9NPD7 142 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 NDUFB8O95169 186 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 Q5BKY6 102 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM160Q9NX00 188 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 A6NDN8 102 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 WDR86Q86TI4 376 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 Q8NA96 180 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 SPRY4Q9C004 299 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IFT22Q9H7X7 185 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 LMO1P25800 156 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ORMDL3Q8N138 153 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1W2PPI3 338 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 CCL24O00175 119 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 BIVMQ86UB2 503 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 IGKV1-5P01602 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 RNF151Q2KHN1 245 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-205ENST00000368213 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms