RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PRR32B1ATL7 298 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 KLK10O43240 276 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 M0R381 172 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GUSBP1Q15486 140 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 OOSP1A8MZH6 123 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf79P0CE67 100 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKN1AP38936 164 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CCL13Q99616 98 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 SPXQ9BT56 116 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 J3KT08 172 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 K7EP13 123 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 AGRNO00468 2067 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 K7EP34 96 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CD28P10747 220 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 FHL5Q5TD97 284 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 JPT2Q9H910 190 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 HLA-DMBP28068 263 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 DRD3P35462 400 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CD69Q07108 199 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 NPIPB3Q92617 1050 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 LEAP2Q969E1 77 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 hDV102S1A0JD36 115 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 ID3Q02535 119 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 AZU1P20160 251 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE12JA6NER3 117 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE7O76087 117 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE12FP0CL80 117 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE12GP0CL81 117 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE12IP0CL82 117 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE4Q13068 117 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 EFEMP2O95967 443 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF125Q96EQ8 232 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 EGR4Q05215 589 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 LCN12Q6JVE5 192 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf172C9J069 976 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 EFNB3Q15768 340 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX3Q96PT4 197 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 DPM3Q9P2X0 92 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGFBP2P18065 325 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PMS2CLQ68D20 193 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 LILRA6Q6PI73 481 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 EVI2AP22794 236 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PSG3Q16557 428 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GLMPQ8WWB7 406 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00477Q96M19 166 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 PF4V1P10720 104 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 MST1LQ2TV78 715 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV3-23P01764 117 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CD33P20138 364 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE5Q13069 117 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 GAGE6Q13070 117 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 NBR2O15453 112 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A16P16260 332 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF492Q9P255 531 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV3-20P01619 116 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXL2P58012 376 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 Q6ZVH6 145 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms