RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP10-11P60412 298 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF266Q14584 549 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 STPG3Q8N7X2 389 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 RNF2Q99496 336 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 NEURL2Q9BR09 285 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 MFFQ9GZY8 342 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA5P01569 189 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ORM2P19652 201 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 S100A7P31151 101 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 MIC13Q5XKP0 118 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN4O14817 238 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 HYPMO75409 117 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 C1QBP02746 253 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 B2MP61769 119 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZRG5 221 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GLMPQ8WWB7 406 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ARL6Q9H0F7 186 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF785A8K8V0 405 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 H3BRN7 92 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 TAAR5O14804 337 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GP9P14770 177 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PATE2Q6UY27 113 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 TCF24Q7RTU0 167 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 S100A7AQ86SG5 101 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF709Q8N972 641 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 RSG1Q9BU20 258 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ARV1Q9H2C2 271 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 DOK5Q9P104 306 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0D9SG52 128 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 HELTA6NFD8 242 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF98A6NK75 572 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 OR5G3P0C626 314 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 HYLS1Q96M11 299 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PFDN5Q99471 154 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 COX7A2P2O60397 106 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 CXCL2P19875 107 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 CD300CQ08708 224 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 UHRF2Q96PU4 802 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 RNF24Q9Y225 148 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 JTBO76095 146 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GUCA2BQ16661 112 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GPR82Q96P67 336 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PRR25Q96S07 402 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 OR4C46A6NHA9 309 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V0CP27449 155 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 PAFAH1B2P68402 229 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 BCL2L11O43521 198 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 DCANP1Q8TF63 244 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC42-201ENST00000293845 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms