RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 ARV1Q9H2C2 271 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 RABAC1Q9UI14 185 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 COX7A2P2O60397 106 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 HYPMO75409 117 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 SAP30O75446 220 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 CBLN1P23435 193 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 NPPCP23582 126 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 CRYBB3P26998 211 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 PRR31Q5SQ13 230 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 UHRF2Q96PU4 802 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 SMPXQ9UHP9 88 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 C8orf88P0DMB2 117 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 IGLL1P15814 213 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 Q6ZRG5 221 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 ST8SIA2Q92186 375 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 MLXQ9UH92 298 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 U3KQE9 123 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL25-201ENST00000253451 H3BRN7 92 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 CHEK1O14757 476 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 RAB2AP61019 212 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 STOML3Q8TAV4 291 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 MARC2Q969Z3 335 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 VSIRQ9H7M9 311 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 MORN5Q5VZ52 161 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 LEMD1Q68G75 181 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 PFDN5Q99471 154 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SPP1P10451 314 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 C4BPBP20851 252 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SLC51BQ86UW2 128 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 BAP18Q8IXM2 172 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 RNF2Q99496 336 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SLC25A22Q9H936 323 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 ZNF98A6NK75 572 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 BUB3O43684 328 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TMED6Q8WW62 240 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 GLMPQ8WWB7 406 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.86□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 A0A1W2PS18 150 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 IGLV1-51P01701 117 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 M6PRP20645 277 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 BMI1P35226 326 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SERF2P84101 59 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 FAM78BQ5VT40 261 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TCF24Q7RTU0 167 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.85□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 SEC11BP0C7V7 166 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 RPRMQ9NS64 109 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.84□□□□□ -0.51
CCL25-201ENST00000253451 FUT9Q9Y231 359 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms