RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TRGV9Q99603 122 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 CD55P08174 381 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SDK2Q58EX2 2172 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SFTA2Q6UW10 78 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 OSTCQ9NRP0 149 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 IGKCP01834 107 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 CFHR3Q02985 330 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 C18orf12Q96KH6 178 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 NPC2P61916 151 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 CLPSP04118 112 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE12JA6NER3 117 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE1Q13065 139 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE4Q13068 117 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE5Q13069 117 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE13Q4V321 117 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 RHODO00212 210 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TSKUQ8WUA8 353 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ERG28Q9UKR5 140 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GV72 72 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 VWC2LB2RUY7 222 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 LEPROTO15243 131 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 NBL1P41271 181 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 PSG3Q16557 428 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 VWC2Q2TAL6 325 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 WDR90Q96KV7 1748 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 C22orf46C9J442 243 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 CTAG1AP78358 180 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SCN2AQ99250 2005 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 EFNA2O43921 213 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 DDTP30046 118 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01559Q495D7 138 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 C5orf30Q96GV9 206 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SMPXQ9UHP9 88 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE12BA1L429 117 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ATP6V0E1O15342 81 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE7O76087 117 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE12FP0CL80 117 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE12GP0CL81 117 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAGE12IP0CL82 117 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 LMO1P25800 156 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 Q8TAT8 98 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 CSTL1Q9H114 145 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 THADAQ6YHU6 1953 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087WWL8 130 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 TREML4Q6UXN2 200 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 NCR2O95944 276 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 GAS1P54826 345 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-201ENST00000220888 PAX9P55771 341 aa8.59□□□□□ -1.03
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