RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633953.1

LAD1-208, Transcript of ladinin 1, human

APPRIS P1 TSL 4

Gene LAD1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAD1-208	ENST00000633953	MPDU1	O75352	247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	OR2C1	O95371	312 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	C4BPB	P20851	252 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ADM	P35318	185 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ZNF616	Q08AN1	781 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953		Q8WTZ3	238 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	AGPAT2	O15120	278 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	BCL2L11	O43521	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	MYCNOS	P40205	109 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	CAMLG	P49069	296 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	JTB	O76095	146 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	YIF1A	O95070	293 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	TOMM40	O96008	361 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	SELENOT	P62341	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ZNF90	Q03938	601 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	MGST2	Q99735	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	PF4	P02776	101 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	PSG1	P11464	419 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	SLURP1	P55000	103 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	OPCML	Q14982	345 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	GPHB5	Q86YW7	130 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
LAD1-208	ENST00000633953	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	NDUFA4	O00483	81 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	RYR2	Q92736	4967 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	IL4	P05112	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	LINC00869	P0C866	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	LYZ	P61626	148 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	B2M	P61769	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	FHL3	Q13643	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953		Q6ZRG5	221 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	LGALS9	O00182	355 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	CD33	P20138	364 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LAD1-208	ENST00000633953	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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