RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 GNB4Q9HAV0 340 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DNAH2Q9P225 4427 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 FNDC10F2Z333 226 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 I3L2K1 104 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFB8O95169 186 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 P2RY1P47900 373 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 BAXQ07812 192 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR4X1Q8NH49 305 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GINS3Q9BRX5 216 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RNF24Q9Y225 148 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 HSPG2P98160 4391 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 H0YIZ8 118 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 H3BP45 60 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 K7EIM0 57 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TGOLN2O43493 480 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CLN5O75503 358 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC3BP05452 202 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NMBP08949 121 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 M6PRP20645 277 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GPR183P32249 361 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 INSL3P51460 131 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DLK1P80370 383 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 AKR1C1Q04828 323 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 FHL3Q13643 280 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ATP6V1FQ16864 119 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GPHB5Q86YW7 130 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LILRB2Q8N423 598 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MARC2Q969Z3 335 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ACY3Q96HD9 319 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RAX2Q96IS3 184 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RNF126Q9BV68 326 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.98□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SMCO3A2RU48 225 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR2T8A6NH00 312 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZFP92A6NM28 416 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 C15orf62A8K5M9 175 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA4O00483 81 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OVOL1O14753 267 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DFFBO76075 338 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CD5P06127 495 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR10J1P30954 320 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SULT1A1P50225 295 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RND2P52198 227 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MFAP2P55001 183 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 COMMD7Q86VX2 200 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 Q8WTZ3 238 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR4C12Q96R67 309 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.97□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.96□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 A0A087WW49 117 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF320A2RRD8 509 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 LGALS9O00182 355 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 BMPR1BO00238 502 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 MPDU1O75352 247 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 JTBO76095 146 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 YIF1AO95070 293 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-23P01764 117 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 SELENOTP62341 195 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 DEFB136Q30KP8 78 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TEPPQ6URK8 271 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 BAP18Q8IXM2 172 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 NPIPB3Q92617 1050 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms