RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 DDB2Q92466 427 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 FAM231BA6NCW3 169 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 BMPR1BO00238 502 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 F2RL2O00254 374 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SCGB1A1P11684 91 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 MC5RP33032 325 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 RAB9AP51151 201 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 RAB31Q13636 194 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CENPWQ5EE01 88 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SGK494Q96LW2 274 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 NABP2Q9BQ15 211 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 C7orf71A4D174 169 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PLAUP00749 431 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CCL3L1P16619 93 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CRYBA4P53673 196 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 UBE2G1P62253 170 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 MORN5Q5VZ52 161 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TBR1Q16650 682 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 RAXQ9Y2V3 346 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 HELTA6NFD8 242 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 MT-ND6P03923 174 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 LINC00869P0C866 280 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 GNG4P50150 75 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 DLX1P56177 255 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TNXAQ16473 311 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 OR52E5Q8NH55 327 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 OR8B2Q96RD0 313 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 THYN1Q9P016 225 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 A0A087X0K7 114 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 hDV102S1A0JD36 115 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 E7EUB6 86 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 M0R2Z0 102 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CT45A6P0DMU7 189 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CT45A5P0DMU8 189 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CT45A7P0DMV0 189 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 MZT1Q08AG7 82 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SIGMAR1Q99720 223 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CHODLQ9H9P2 273 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ST20Q9HBF5 79 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 RNF7Q9UBF6 113 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 HSBP1O75506 76 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 IGHV1-46P01743 117 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 BSNQ9UPA5 3926 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 OR4C46A6NHA9 309 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PSG3Q16557 428 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF503Q96F45 646 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 GGTLC3B5MD39 225 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CGB3P0DN86 165 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CGB7P0DN87 165 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 GLRXP35754 106 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PPOXP50336 477 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TMPRSS3P57727 454 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PLP1P60201 277 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 OR4A5Q8NH83 315 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 GAFA1Q96PS6 74 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms