RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.21□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 WNK2Q9Y3S1 2297 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS47A8MTI9 375 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 APELAP0DMC3 54 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FA2HQ7L5A8 372 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RND1Q92730 232 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ASCL2Q99929 193 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF292O60281 2723 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KLK10O43240 276 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF146Q15072 292 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 OR4A5Q8NH83 315 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 Q8TCH9 128 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PROCRQ9UNN8 238 aa13.2□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PGPA6NDG6 321 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 A6NDN8 102 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ACP7Q6ZNF0 438 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JLM5 398 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV2-8P01709 118 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GUSBP1Q15486 140 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PEX7O00628 323 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HSPB8Q9UJY1 196 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LIPFP07098 398 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MOGAT3Q86VF5 341 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 OR10W1Q8NGF6 305 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GCSHP23434 173 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 UTF1Q5T230 341 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KIR3DS1Q14943 382 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MSMPQ1L6U9 139 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CD177Q8N6Q3 437 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PROP1O75360 226 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 COL8A1P27658 744 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF503Q96F45 646 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRDX2P32119 198 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MTURNQ8N3F0 131 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf159Q96HA4 380 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 JKAMPQ9P055 326 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 K7EM74 188 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KALRNO60229 2985 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 A8MWL6 223 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRR33A8MZF0 331 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV3-15P01624 115 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FCER1GP30273 86 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PDPNQ86YL7 162 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FABP2P12104 132 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 AZU1P20160 251 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RABAC1Q9UI14 185 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TANC2Q9HCD6 1990 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA4P78363 2273 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RELNP78509 3460 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRR20EP86478 221 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRR20CP86479 221 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRR20DP86480 221 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRR20BP86481 221 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRR20AP86496 221 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa13.15□□□□□ -0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PRD5 423 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PRF3 423 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PRM7 423 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 VWC2LB2RUY7 222 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 K7EMI3 77 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ADH4P08319 380 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF788Q6ZQV5 615 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB3Q92617 1050 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 JMJD8Q96S16 334 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF134P52741 427 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNRD1Q9P1U0 126 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DKK4Q9UBT3 224 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf61A6NNL5 157 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.6 ms