RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV4-59P01825 116 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 PSG1P11464 419 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 NPPCP23582 126 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 GCHFRP30047 84 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 PPT1P50897 306 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 BLCAPP62952 87 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 CFHR3Q02985 330 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 TIGITQ495A1 244 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 FAM78BQ5VT40 261 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 NANPQ8TBE9 248 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR2J3O76001 311 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CTSGP08311 255 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C8orf88P0DMB2 117 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 KIR3DS1Q14943 382 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 LY6EQ16553 131 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 SVBPQ8N300 66 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 RNF2Q99496 336 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TXN2Q99757 166 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 MANBALQ9NQG1 85 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM250H0YL14 139 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 PAGE4O60829 102 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TOMM40O96008 361 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 NPBWR1P48145 328 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 MFAP4P55083 255 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 PFDN5Q99471 154 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CENPEQ02224 2701 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FAM74A7A6NL05 159 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR2C1O95371 312 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 IFNA1P01562 189 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 MYCNOSP40205 109 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 RHOGP84095 191 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 DEFA5Q01523 94 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ECSCRQ19T08 205 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 NECAP1Q8NC96 275 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 OR5R1Q8NH85 324 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 FXYD5Q96DB9 178 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CCDC140Q96MF4 163 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 UHRF2Q96PU4 802 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ATP6V0BQ99437 205 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 THYN1Q9P016 225 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 S4R3C0 116 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 H3BQ15 152 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 COX7A2P2O60397 106 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 HYPMO75409 117 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 SNAPINO95295 136 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 RD3LP0DJH9 198 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ATP5G3P48201 142 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C15orf32Q32M92 178 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C11orf52Q96A22 123 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 DOK5Q9P104 306 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 ABCA1O95477 2261 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1W2PRE2 83 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 C11orf94C9JXX5 98 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 H3BUA1 57 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA6-210ENST00000475302 CD5LO43866 347 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms