RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 DEFA5Q01523 94 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DEFB135Q30KP9 77 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MIR17HGQ75NE6 70 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 STX19Q8N4C7 294 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 OR51A2Q8NGJ7 313 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 FAM45AQ8TCE6 357 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 RAB37Q96AX2 223 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MS4A6EQ96DS6 147 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 FAM210AQ96ND0 272 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CRACR2AQ9BSW2 395 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 COPS4Q9BT78 406 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 UGT2B28Q9BY64 529 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 XAGE1AQ9HD64 81 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GPR84Q9NQS5 396 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 BLOC1S6Q9UL45 172 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 NEURL4Q96JN8 1562 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 RELNP78509 3460 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.35□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DLEC1Q9Y238 1755 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 METTL15A6NJ78 407 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 F2Z2F3 143 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 HAND1O96004 215 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 TFF1P04155 84 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 COX6A1P12074 109 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CDC42P60953 191 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DYNLT1P63172 113 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C6orf183Q5T699 404 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CASC1Q6TDU7 716 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C10orf111Q8N326 155 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF321PQ8N8H1 164 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC148Q8NFR7 591 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SLC37A2Q8TED4 501 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DOK4Q8TEW6 326 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SLAMF6Q96DU3 332 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 OR52E6Q96RD3 313 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM208Q9BTX3 173 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MROQ9BYG7 248 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C14orf132Q9NPU4 83 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 IFNKQ9P0W0 207 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CLEC2DQ9UHP7 191 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM94Q12767 1356 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 KIF15Q9NS87 1388 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.36□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA3Q08378 1498 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 A0A0A6YYH2 397 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 A6NJ64 397 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 E7EUB6 86 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 H0Y980 276 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MKRN2OSH3BPM6 223 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CXCR6O00574 342 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 COPEO14579 308 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GATCO43716 136 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CYTH3O43739 400 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 FADS2O95864 444 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DAD1P61803 113 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 FABP5Q01469 135 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 SSX2Q16385 188 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 FBXO48Q5FWF7 155 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C8orf74Q6P047 294 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C2orf82Q6UX34 121 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C4orf22Q6V702 233 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 BLIDQ8IZY5 108 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 UBL4BQ8N7F7 174 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 ISOC1Q96CN7 298 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CERS2Q96G23 380 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 GPER1Q99527 375 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 PARVAQ9NVD7 372 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 RMND1Q9NWS8 449 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 STMN3Q9NZ72 180 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 ERGIC3Q9Y282 383 aa-1.37□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 TANC2Q9HCD6 1990 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 TRIOO75962 3097 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 OR4C45A6NMZ5 311 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 IFITM5A6NNB3 132 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 CENPXA8MT69 81 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf196B1AJZ1 125 aa-1.38□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms