RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 SLC35E1Q96K37 410 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 SRRQ9GZT4 340 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 ZFP92A6NM28 416 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 BUB3O43684 328 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 ZNF688P0C7X2 276 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 SPP1P10451 314 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 PPP1R1AQ13522 171 aa11.32□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 OR11H2Q8NH07 326 aa11.32□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 NRN1Q9NPD7 142 aa11.3□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 PSMG4Q5JS54 123 aa11.29□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.29□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.29□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 C9orf170A2RU37 121 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 KNCNA6PVL3 124 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 ZNF90Q03938 601 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.28□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-205ENST00000467594 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
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NISCH-205ENST00000467594 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 THAP8Q8NA92 274 aa11.27□□□□□ -0.61
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NISCH-205ENST00000467594 S100A7P31151 101 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 ID1P41134 155 aa11.25□□□□□ -0.61
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NISCH-205ENST00000467594 ADAP1O75689 374 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 LY6G6CO95867 125 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 C4BPBP20851 252 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 OR2F1Q13607 317 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 C4orf46Q504U0 113 aa11.24□□□□□ -0.61
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NISCH-205ENST00000467594 DEFB4AO15263 64 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 IL7P13232 177 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 PSMB3P49720 205 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
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NISCH-205ENST00000467594 HRH4Q9H3N8 390 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 RYR2Q92736 4967 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 H3BP45 60 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 HLA-DRB4P13762 266 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 BTCP35070 178 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 AKR1C1Q04828 323 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-205ENST00000467594 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.22□□□□□ -0.61
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