RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 AMBPP02760 352 aa14.78□□□□□ -0.04
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CAPN3-209ENST00000466222 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 Q8N6K4 173 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPN3-209ENST00000466222 C11orf52Q96A22 123 aa14.78□□□□□ -0.04
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CAPN3-209ENST00000466222 FSHBP01225 129 aa14.77□□□□□ -0.04
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CAPN3-209ENST00000466222 STPG3Q8N7X2 389 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 CGB1A6NKQ9 187 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 FAM106CPP0CH98 169 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 PRR20CP86479 221 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 PRR20DP86480 221 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 TEX45Q8NA69 505 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 SLC35E1Q96K37 410 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.76□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 BRS3P32247 399 aa14.75□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.75□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 LY6EQ16553 131 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 NPBQ8NG41 125 aa14.74□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.74□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.74□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 H3BUX3 64 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 C2orf83Q53S99 150 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 OR5B3Q8NH48 314 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 OR4A5Q8NH83 315 aa14.73□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 TEX38Q6PEX7 206 aa14.72□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.72□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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CAPN3-209ENST00000466222 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV4-59P01825 116 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 LINC00869P0C866 280 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 RD3LP0DJH9 198 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 IL36BQ9NZH7 164 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPN3-209ENST00000466222 REG1AP05451 166 aa14.7□□□□□ -0.06
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