RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461849.1

RBM39-222, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-222	ENST00000461849	ADM	P35318	185 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	NHLH2	Q02577	135 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM39-222	ENST00000461849	RYR3	Q15413	4870 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF320	A2RRD8	509 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	RNF222	A6NCQ9	220 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	DFFB	O76075	338 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	C1QB	P02746	253 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	OR10J1	P30954	320 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	AKR1C1	Q04828	323 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF345	Q14585	488 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TRGV9	Q99603	122 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	LGALS9	O00182	355 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ARPC5	O15511	151 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	MPDU1	O75352	247 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	FABP1	P07148	127 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	FOLR2	P14207	255 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CD81	P60033	236 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	OR2F1	Q13607	317 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	MUC7	Q8TAX7	377 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ATP5S	Q99766	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	NDUFA4	O00483	81 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	SPATA25	Q9BR10	227 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TOMM40	O96008	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CBLN1	P23435	193 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	SELENOT	P62341	195 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CLINT1	Q14677	625 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	FBXL17	Q9UF56	701 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849		A0A0D9SG52	128 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849		A8MWP6	167 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TAAR5	O14804	337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CD300C	Q08708	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	RAB31	Q13636	194 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF266	Q14584	549 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	HAGH	Q16775	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	PFDN1	O60925	122 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	IFNA5	P01569	189 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	EDN2	P20800	178 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CASC10	Q5T4H9	136 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849		Q8WTZ3	238 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	MGST2	Q99735	147 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM39-222	ENST00000461849	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM39-222	ENST00000461849	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM39-222	ENST00000461849		K7EMT4	169 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM39-222	ENST00000461849	AGPAT2	O15120	278 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM39-222	ENST00000461849	CD7	P09564	240 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM39-222	ENST00000461849	PSG1	P11464	419 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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