RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 LY6DQ14210 128 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CSRP2Q16527 193 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CR1LQ2VPA4 569 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LIFP15018 202 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LHFPL1Q86WI0 220 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 UBL5Q9BZL1 73 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 V9GYV3 84 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf70A6NJV1 201 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 GHRHP01286 108 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CFC1BP0CG36 223 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CFC1P0CG37 223 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FOXF1Q12946 379 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 D6R8Y8 96 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 H0YIG0 161 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TM4SF5O14894 197 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CSRP3P50461 194 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CRYBA2P53672 197 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FXYD7P58549 80 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01587Q99440 93 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRFP10586 1907 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MGPP08493 103 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PSMB8P28062 276 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SP8Q8IXZ3 490 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CDIP1Q9H305 208 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FMN2Q9NZ56 1722 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC6L2Q5T890 1561 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 KIF13BQ9NQT8 1826 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 GFERP55789 205 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DPTQ07507 201 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf128Q5T292 105 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 VWCEQ96DN2 955 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MDFICQ9P1T7 246 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 VWC2LB2RUY7 222 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 J3QRE1 110 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 K7EMI3 77 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FMC1Q96HJ9 113 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 METTL26Q96S19 204 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZQT7 251 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00596Q86U02 117 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LIME1Q9H400 295 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DPH3Q96FX2 82 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DEPPQ9NTK1 212 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DOCK3Q8IZD9 2030 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SEC16AO15027 2179 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MON2Q7Z3U7 1717 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PR77 199 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SPEM2Q0P670 501 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DLG5Q8TDM6 1919 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L23D6RBM5 183 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DEFA4P12838 97 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.4 ms