RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	MS4A10	Q96PG2	267 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	RCHY1	Q96PM5	261 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	C3orf84	H3BNL1	204 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	BMPR1B	O00238	502 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	TGOLN2	O43493	480 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	CLEC3B	P05452	202 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	CASC10	Q5T4H9	136 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC51B	Q86UW2	128 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	MUC7	Q8TAX7	377 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	MGST2	Q99735	147 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARL6	Q9H0F7	186 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561		A0A087WW49	117 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561		A8MWP6	167 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	LGALS9	O00182	355 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	OVOL1	O14753	267 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	SAP30	O75446	220 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	TOMM40	O96008	361 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRBV12-3	P01733	135 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	IGHV3-11	P01762	117 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	LINC00869	P0C866	280 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	OR10J1	P30954	320 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	CLINT1	Q14677	625 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	BTNL8	Q6UX41	500 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	LILRB2	Q8N423	598 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
TP53BP1-208	ENST00000434561	NDUFA4	O00483	81 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	AGPAT2	O15120	278 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SCGB2A1	O75556	95 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPP1	P10451	314 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	C4BPB	P20851	252 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPR183	P32249	361 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SERF2	P84101	59 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	DEFA5	Q01523	94 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ACSM6	Q6P461	480 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561		U3KQE9	123 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	OR2T8	A6NH00	312 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561		K7EMT4	169 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	GNG7	O60262	68 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	IFNA5	P01569	189 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	IGHV3-48	P01763	117 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	FABP1	P07148	127 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	PSG1	P11464	419 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	GP9	P14770	177 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZP3	P21754	424 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	FGF7	P21781	194 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	CAMLG	P49069	296 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	AKR1C1	Q04828	323 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	BAP18	Q8IXM2	172 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TP53BP1-208	ENST00000434561	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms