RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC3BP05452 202 aa22.8■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 GPR183P32249 361 aa22.8■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 ACY3Q96HD9 319 aa22.8■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 RPRMQ9NS64 109 aa22.8■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 FHITP49789 147 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 RND2P52198 227 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 FFAR4Q5NUL3 377 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 TXN2Q99757 166 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 OR2T8A6NH00 312 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN15O95858 294 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD7Q86VX2 200 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 OR4X1Q8NH49 305 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPB3Q92617 1050 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 SLC45A2Q9UMX9 530 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PXMP4Q9Y6I8 212 aa22.79■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PPP5D1E7EU14 171 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1G1O75348 118 aa22.78■■□□□ 1.24
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ECHS1-201ENST00000368547 NPBWR1P48145 328 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PRR20EP86478 221 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PRR20CP86479 221 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PRR20DP86480 221 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PRR20BP86481 221 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 PRR20AP86496 221 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF616Q08AN1 781 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 FAM209BQ5JX69 171 aa22.78■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 DUX3Q96PT4 197 aa22.78■■□□□ 1.24
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ECHS1-201ENST00000368547 ELLP55199 621 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 OR11H1Q8NG94 326 aa22.77■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V0BQ99437 205 aa22.77■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 VSIRQ9H7M9 311 aa22.77■■□□□ 1.24
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa22.76■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087WW49 117 aa22.76■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 IL34Q6ZMJ4 242 aa22.76■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 RAX2Q96IS3 184 aa22.76■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 CLN5O75503 358 aa22.75■■□□□ 1.23
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ECHS1-201ENST00000368547 B2MP61769 119 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 OR1N2Q8NGR9 330 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 HRH4Q9H3N8 390 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 TGOLN2O43493 480 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 H2AFB1P0C5Y9 115 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 SELENOTP62341 195 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 MIC13Q5XKP0 118 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 STPG3Q8N7X2 389 aa22.75■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 TRGV9Q99603 122 aa22.75■■□□□ 1.23
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ECHS1-201ENST00000368547 OR10G9Q8NGN4 311 aa22.74■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 OR10G7Q8NGN6 311 aa22.74■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 MBD3L1Q8WWY6 194 aa22.74■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 MARC2Q969Z3 335 aa22.74■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 CHRDL1Q9BU40 450 aa22.74■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 CCL24O00175 119 aa22.73■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 YIF1AO95070 293 aa22.73■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00869P0C866 280 aa22.73■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 ADMP35318 185 aa22.73■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 DPF1Q92782 380 aa22.73■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 RAB19A4D1S5 217 aa22.72■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP92A6NM28 416 aa22.72■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 TEX46H3BTG2 121 aa22.72■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 HBE1P02100 147 aa22.72■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 SEC14L6B5MCN3 397 aa22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01619G3V211 115 aa22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 SPSB3Q6PJ21 355 aa22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 GGCTO75223 188 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF726P1Q15940 193 aa22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 OR4F17Q8NGA8 305 aa22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 OR4F4Q96R69 305 aa22.71■■□□□ 1.23
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa22.7■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa22.7■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 IGLC1P0CG04 106 aa22.7■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 FHL3Q13643 280 aa22.7■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 BPIFCQ8NFQ6 507 aa22.7■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa22.69■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 OR2C1O95371 312 aa22.69■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 SFT2D1Q8WV19 159 aa22.69■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-17P01599 117 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 ZP3P21754 424 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 MYCNOSP40205 109 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 SLURP1P55000 103 aa22.68■■□□□ 1.22
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