RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 RNF114Q9Y508 228 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 VCYO14598 125 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 H3BTX0 84 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01551Q86U37 167 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 IGLV1-44P01699 117 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 Q0VG73 95 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 PSG1P11464 419 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BOP23527 126 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BDP58876 126 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 C15orf62A8K5M9 175 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 C15orf32Q32M92 178 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 EGR1P18146 543 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 Q86TA4 180 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 PSPNO60542 156 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 PYYP10082 97 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 DERL1Q9BUN8 251 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 SCN5AQ14524 2016 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 MLNRO43193 412 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 SH2D1AO60880 128 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 ATXN8Q156A1 80 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 KLK15Q9H2R5 256 aa7.36□□□□□ -1.23
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