RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	MLANA	Q16655	118 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	GABARAP	O95166	117 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNA10	P01566	189 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	CD74	P04233	296 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	C4BPB	P20851	252 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	NPY1R	P25929	384 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZTC4	211 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	NXPH3	O95157	252 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	CDS2	O95674	445 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	IL18	Q14116	193 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRRT1	Q99946	306 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	TOMM40	O96008	361 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	FABP1	P07148	127 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR20E	P86478	221 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR20C	P86479	221 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR20D	P86480	221 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR20B	P86481	221 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR20A	P86496	221 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZRM9	215 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	GLMP	Q8WWB7	406 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR146	Q96CH1	333 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TARDBP-231	ENST00000639599	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	ANXA3	P12429	323 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	ID1	P41134	155 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR141	Q7Z602	305 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599		X6R8D5	127 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599		P0DMU3	169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	CTF1	Q16619	201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	AARD	Q4LEZ3	155 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TARDBP-231	ENST00000639599	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71

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