RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	AES	Q08117	197 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	KISS1	Q15726	138 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGY	Q3MUY2	71 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	COX19	Q49B96	90 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPD6	Q86Y78	171 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	IGSF23	A1L1A6	192 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC17A3	O00476	420 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MPIG6B	O95866	241 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RFESD	Q8TAC1	157 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	HARBI1	Q96MB7	349 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	AKAP9	Q99996	3911 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C7orf71	A4D174	169 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF737	O75373	536 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7A1	P24310	79 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GNG4	P50150	75 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	QRFP	P83859	136 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TESK1	Q15569	626 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MKX	Q8IYA7	352 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXC2	Q99958	501 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLL1	P15814	213 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMB3	P49720	205 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE5	Q13069	117 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE6	Q13070	117 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC119	Q13432	240 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GALM	Q96C23	342 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR82	Q96P67	336 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PPV4	95 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM231B	A6NCW3	169 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	F2RL2	O00254	374 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CA2	P00918	260 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM187	Q14656	261 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LCN15	Q6UWW0	184 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ASCL4	Q6XD76	172 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SPSB4	Q96A44	273 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NDN8	102 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OOEP	A6NGQ2	149 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BRM9	83 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HBZ	P02008	142 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MT-ND6	P03923	174 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	NAA60	Q9H7X0	242 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PS18	150 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	VSIG8	P0DPA2	414 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL3L1	P16619	93 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR12	P47775	334 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	REG1B	P48304	166 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNLT3	P51808	116 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SERF2	P84101	59 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CR1L	Q2VPA4	569 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TCF23	Q7RTU1	214 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LEAP2	Q969E1	77 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8B2	Q96RD0	313 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SPIN2A	Q99865	258 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RPRM	Q9NS64	109 aa		5.89	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms