RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593261.1

NEK8-208, Transcript of NIMA related kinase 8, human

TSL 3

Gene NEK8, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK8-208	ENST00000593261	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NEK8-208	ENST00000593261	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261		A0A0U1RQK1	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261		H0YJW9	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR4A8	P0C604	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR10J1	P30954	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PKIA	P61925	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	SSX2	Q16385	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PNKD	Q8N490	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261		A0A1W2PN81	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261		B4DSR2	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	FOXH1	O75593	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	AVP	P01185	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	MSMB	P08118	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR5G3	P0C626	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	CCL3L1	P16619	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TAS2R45	P59539	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	CCL8	P80075	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	CD69	Q07108	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	GAMT	Q14353	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	RNF2	Q99496	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261		K7EN84	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK8-208	ENST00000593261	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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