RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 LYG2Q86SG7 212 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-203ENST00000587752 LGI3Q8N145 548 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-203ENST00000587752 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CTIF-203ENST00000587752 RNF183Q96D59 192 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-203ENST00000587752 RBKSQ9H477 322 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-203ENST00000587752 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-203ENST00000587752 CSMD3Q7Z407 3707 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 A0A0B4J2A0 478 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 A0A1W2PS18 150 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CD5P06127 495 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 SLC25A4P12235 298 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 ANXA3P12429 323 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 OR10J1P30954 320 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 S100A5P33763 92 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 P2RY1P47900 373 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CCR6P51684 374 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 AP3S2P59780 193 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 TNFRSF9Q07011 255 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 OR1S1Q8NH92 325 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 DTD1Q8TEA8 209 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 NPIPB3Q92617 1050 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 ACY3Q96HD9 319 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CSTL1Q9H114 145 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CXorf65A6NEN9 183 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 VAMP1P23763 118 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CRYBB3P26998 211 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 SRPXP78539 464 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 AGRNO00468 2067 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 MPTX1A8MV57 137 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 JTBO76095 146 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CCDC190Q86UF4 302 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 Q8WTZ3 238 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 IFNA4P05014 189 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 IL4P05112 153 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 11.8
CTIF-203ENST00000587752 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 NOXA1Q86UR1 476 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 U3KQ87 197 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 K7EQG2 157 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 ZNF688P0C7X2 276 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 IAPPP10997 89 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 U3KQE9 123 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 KNCNA6PVL3 124 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 TOMM40O96008 361 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 RD3LP0DJH9 198 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R1AQ13522 171 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 STHQ8IWL8 128 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 RARRES2Q99969 163 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 SRRQ9GZT4 340 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-203ENST00000587752 RYR2Q92736 4967 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 PITX3O75364 302 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 SFT2D2O95562 160 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 HOXB5P09067 269 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 PSG1P11464 419 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 DHRS2Q13268 280 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 OR11H2Q8NH07 326 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 DCANP1Q8TF63 244 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 GLMPQ8WWB7 406 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 DEFB4AO15263 64 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 INPP1P49441 399 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 GAMTQ14353 236 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 BAK1Q16611 211 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 SLC35E1Q96K37 410 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 HELTA6NFD8 242 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 ZFP92A6NM28 416 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 ZNF90Q03938 601 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 PSMG4Q5JS54 123 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 ACTL10Q5JWF8 245 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 TRIQKQ629K1 86 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-203ENST00000587752 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms