RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNA1H	O95180	2353 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	HSBP1	O75506	76 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TCF21	O43680	179 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FCN3	O75636	299 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	MOS	P00540	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	SELENOV	P59797	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF714	Q96N38	554 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743		H3BTX0	84 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743		M0QZ24	198 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	APELA	P0DMC3	54 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	PMCHL1	Q16048	86 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FXYD5	Q96DB9	178 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	hADV38S2	A0JD32	116 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743		M0R2Z0	102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	APOA2	P02652	100 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ORM2	P19652	201 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TM4SF5	O14894	197 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FSTL3	O95633	263 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00614	P0C842	121 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	RITA1	Q96K30	269 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743		M0R296	226 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	TSPO	P30536	169 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	HCP5	Q6MZN7	132 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SNHG16-205	ENST00000587743	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC25A17	O43808	307 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	UBE2G1	P62253	170 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	PGP	A6NDG6	321 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	C22orf46	C9J442	243 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	IGLL1	P15814	213 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	BPIFB3	P59826	476 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM177	Q53S58	311 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	LOXL4	Q96JB6	756 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1W2PPI3	338 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	TNFSF4	P23510	183 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	CD40	P25942	277 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	DEFB124	Q8NES8	71 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	C2orf70	A6NJV1	201 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SNHG16-205	ENST00000587743	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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