RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-208	ENST00000563857	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	WRB	O00258	174 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	SYNGR2	O43760	224 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	S100A7	P31151	101 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	RND2	P52198	227 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	HAGH	Q16775	308 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857		A6NHS1	94 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	NXPH3	O95157	252 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	EDN2	P20800	178 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	DHRS2	Q13268	280 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	VSIR	Q9H7M9	311 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	IGLC1	P0CG04	106 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	APOC4	P55056	127 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	MLANA	Q16655	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	RNF2	Q99496	336 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNPS1-208	ENST00000563857	HELT	A6NFD8	242 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	C3orf84	H3BNL1	204 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	UBE2C	O00762	179 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	DFFB	O76075	338 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	IGKV1-17	P01599	117 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TCRB	P04435	133 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	CRYBB3	P26998	211 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TIGIT	Q495A1	244 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	PLA2G10	O15496	165 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TOMM40	O96008	361 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	BTC	P35070	178 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ID3	Q02535	119 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	IL17D	Q8TAD2	202 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	IAPP	P10997	89 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	CITED4	Q96RK1	184 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	RAB40C	Q96S21	281 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	RABAC1	Q9UI14	185 aa		12	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TAS2R30	P59541	319 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ST8SIA2	Q92186	375 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ADAP1	O75689	374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	IL4	P05112	153 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	P2RY1	P47900	373 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ASAH1	Q13510	395 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	GAMT	Q14353	236 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	TRGV9	Q99603	122 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	DEFA1	P59665	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	DEFA3	P59666	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNPS1-208	ENST00000563857	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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