RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 IFNA17P01571 189 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PSKH1P11801 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GABRR1P24046 479 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SYNJ2BPP57105 145 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TAS2R19P59542 299 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PSG5Q15238 335 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GRK1Q15835 563 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GUK1Q16774 197 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TEX30Q5JUR7 227 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.07□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 LFNGQ8NES3 379 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR2T29Q8NH02 315 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 UBALD1Q8TB05 177 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 AQP3Q92482 292 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 EBF4Q9BQW3 602 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR51I2Q9H344 312 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 AIG1Q9NVV5 245 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 EVPLLA8MZ36 301 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 M0R036 132 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 MOSP00540 346 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GNAO1P09471 354 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CD37P11049 281 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CD36P16671 472 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 PFN2P35080 140 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TPPP2P59282 170 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CXCR4P61073 352 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 TRAM1Q15629 374 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 PRR4Q16378 134 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 COX19Q49B96 90 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 ACTBL2Q562R1 376 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 PRRT1Q99946 306 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CHST6Q9GZX3 395 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 Q9H3A6 140 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A22Q9H936 323 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 DNAH2Q9P225 4427 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 J3QT63 122 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 APOC1P02654 83 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-217ENST00000509355 SEMG1P04279 462 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 CD34P28906 385 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 HRH1P35367 487 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 REG1BP48304 166 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GNG11P61952 73 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 SMCO1Q147U7 214 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-217ENST00000509355 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.05□□□□□ -1.92
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