RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CCL13	Q99616	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458		H0YJW9	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	REG1A	P05451	166 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	OR4A8	P0C604	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	OR10J1	P30954	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	LGALS7	P47929	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PPOX	P50336	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TPPP2	P59282	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	RAB4B	P61018	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CX3CL1	P78423	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PSG5	Q15238	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458		Q9UFV3	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458		V9GYV3	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SVIL	O95425	2214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	MTOR	P42345	2549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	FBN2	P35556	2912 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	DSCAM	O60469	2012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458		K7EN84	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFB3	O43676	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	FOXH1	O75593	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	DEFA4	P12838	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SELL	P14151	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CRISP2	P16562	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	GNG10	P50151	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	BPIFB3	P59826	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SERF1A-204	ENST00000504458	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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