RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10P1Q8NGE3 313 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4X1Q8NH49 305 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP6V0BQ99437 205 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 F8W735 103 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 CST7O76096 145 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 CTSGP08311 255 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 ADMP35318 185 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 PAX9P55771 341 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 TIGITQ495A1 244 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 STX12Q86Y82 276 aa10.24□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM217Q8N7C4 229 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 OR11H7Q8NGC8 314 aa10.24□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM24AA6NFZ4 105 aa10.23□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFA4O00483 81 aa10.23□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 CCNKO75909 580 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.23□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 FABP1P07148 127 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 IL15RAQ13261 267 aa10.22□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 REC114Q7Z4M0 266 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 THAP6Q8TBB0 222 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8WTZ3 238 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 IGSF23A1L1A6 192 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf70A6NJV1 201 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS9O00182 355 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 MPC2O95563 127 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLC1P0CG04 106 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 RD3LP0DJH9 198 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 HBG1P69891 147 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 HBG2P69892 147 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 GINS3Q9BRX5 216 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-204ENST00000503638 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
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PGGT1B-204ENST00000503638 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10.21□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 FOLR2P14207 255 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 P2RY1P47900 373 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 SULT1A1P50225 295 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 INSL3P51460 131 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 DLK1P80370 383 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2F1Q13607 317 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM213A2RRL7 107 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MWP6 167 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 PRSS46E5RG02 174 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 H0YIZ8 118 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-17P01599 117 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 IL4P05112 153 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 CSN3P07498 182 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 EDN2P20800 178 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 CBLN1P23435 193 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 RAP2BP61225 183 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF90Q03938 601 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 FGL1Q08830 312 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 TOMM40O96008 361 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A11P31949 105 aa10.18□□□□□ -0.78
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