RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495292.1

FAM107B-227, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-227	ENST00000495292	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	METTL26	Q96S19	204 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	PRRT1	Q99946	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM50A	O95807	157 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC25A4	P12235	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	NPPC	P23582	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	TFPI2	P48307	235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	IL18	Q14116	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-227	ENST00000495292	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	HELT	A6NFD8	242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SPP1	P10451	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ANXA3	P12429	323 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	CRYBB3	P26998	211 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ETV6	P41212	452 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMBIM6	P55061	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SRPX	P78539	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SP6	Q3SY56	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	STH	Q8IWL8	128 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	RARRES2	Q99969	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	AGRN	O00468	2067 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292		A0A1B0GU03	582 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	LY6G6C	O95867	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	NPY1R	P25929	384 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	P2RY1	P47900	373 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TCTA	P57738	103 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	DEFB131A	P59861	70 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM187	Q14656	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SPCS2	Q15005	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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